矯正期間が長くなってしまっても歯や歯茎に影響はないですか？

基本的には影響はありません。何か心配なことがあれば、レントゲンを撮って歯の状態を確認するので、ご相談ください。
また一般歯科にも定期的に通って、虫歯などの検診をしてください。